依据现有的系统创新分类，本文以2010—2019年中国31个省份区域创新生态系统的数据为样本，利用因子分析构建系统双元创新评价指标体系，基于战略三角理论构建“资源基础—共生网络—制度环境”前因条件组态，利用模糊集定性比较分析探究上述组态与区域创新生态系统高开发、高探索及高水平双元创新的复杂因果关系。研究发现：（1）共生网络作为核心条件包含于区域创新生态系统高开发性创新、高探索性创新及高水平双元创新全部组态。（2）数字化能力与共生网络形成显性基础设施与隐性网络关系的协同效应，促进区域创新生态系统高水平双元创新。（3）资源获取能力作为区域创新生态系统实现高水平双元创新的“边缘条件”，能提高创新主体搜索、获取、编排内外部创新资源的能力，缓解资源约束下自主创新不足等问题。（4）经济制度环境作为区域创新生态系统实现高水平双元创新的“边缘条件”，能为系统创新提供良好的运行框架与制度环境，并与其他前因条件形成良好组态效应。研究既完善了区域创新生态系统双元创新评价与判别体系，为后续研究提供量化基础；又拓宽了双元创新理论应用范畴，为系统治理者提供组态策略集与方法论。